Имеет ли смысл использовать Amazon Glacier для хранения архива фото?

Лично я уверен, что стоит. Сейчас пишу утилиты.
У Вас как отсортированы папки? Одна папка — это одна дата съемки?
Если да, у Вас способ хранения очень близок к моему. Я в этом случае планирую делать так: одна папка с фотографиями => один файл архива.
В этом случае, при необходимости извлечь одну фотку нужно будет закачать один файл архива. Если у Вас 1000 папок, это 1000 файлов архивов, в общей сложности, 500ГБ, значит, в среднем, по 500МБ каждая. Пусть в реальности от 50МБ от 250МБ. В этом случае, даже если Вам нужно вытащить самый большой, но все таки один архив, Вы можете не обращать внимания на ограничение в 5% в месяц. Остальные платежи остаются. Но если потребуется извлечь ВЕСЬ архив. Это или будет долго или дорого.
Так, что Glacier это именно backup.

https://habrahabr.ru/sandbox/73774/
Хранить - дешево.
Быстро скачивать назад - дорого.
Ключевое слово - быстро.

По моему когда потерял данные, то цены гласиера совсем не дорого. Ну либо данные такие не особо нужные и дорогие.

действительно ли выгодно хранение, если скорее всего архивные файлы не будут востребованы достаточно долгое время?

Скажем так — выгоднее, чем подавляющее большинство других схем (в т.ч. Amazon S3)

Удобно ли заливать файлами по отдельности, или лучше паковать пачками в TAR? Как сэкономить на скачивании, если все же приспичит вытащить файлы по отдельности, папку, все?

Лучше паковать. Операции загрузки скачивания стоят $0,05 за 1.000 действий. Каим образом, загрузка 100 000 фотографий обойдётся в 5 долларов, скачивание — ещё минимум в 5 (плюс доп. деньги если трафик превышает 5% от объёма хранимых данных). А если они в архиве — то «тратится» всего 1 действие.

На самом деле у Glacier есть другой большой «минус» — вытаскивание всех данных оттуда в экстренной ситуации (хард рухнул, компьютер украли, дом сгорел) достаточно дорого. К примеру, скачать лежащий там 200 ГБ-архив обойдётся где-то в 25 долларов (при том, что стоимость его хранения была всего 2 доллара/месяц).