Хабрахабр: Метки / нуклеотид http://habrahabr.ru/rss/tag/нуклеотид/ ru editor@habrahabr.ru habrahabr.ru Sat, 11 Feb 2012 15:10:03 GMT http://habrahabr.ru/ http://habrahabr.ru/i/logo.gif Хабрахабр <![CDATA[Биотехнологии / 900 терабайт на 1 г бактерий]]> http://habrahabr.ru/blogs/biotech/108858/ http://habrahabr.ru/blogs/biotech/108858/ Группа исследователей из Китайского университета Гонконга нашла способ шифрования и хранения данных в бактериях. В 1 г живого материала помещается примерно 900 ТБ информации. Проект называется Bioencryption (см. презентацию), и создан он был для международного конкурса iGEM-2010 (International Genetically Engineered Machine).

Шифрование осуществляется методом перемешивания ДНК (DNA shuffle). Считывание информации из бактерий подтверждается контрольной суммой.

Для хранения данных, как и можно было предположить, используется четверичная система счисления, по количеству нуклеотидов (0 = A, 1 = T, 2 = C, 3 = G).
Читать дальше →
]]> Fri, 26 Nov 2010 08:59:55 GMT alizar Bioencryptionбактерияхранение информациишифрование информациинуклеотидiGEMсинтетическая биологиягенная инженериясинтез ДНК <![CDATA[Биотехнологии / [Перевод] О гриппе А (H1N1) с точки зрения программирования]]> http://habrahabr.ru/blogs/biotech/68584/ http://habrahabr.ru/blogs/biotech/68584/ Учёные уже полностью дизассемблировали H1N1 и занесли его в вирусную базу NCBI Influenza Virus Resource. Там всё задокументировано в подробностях. Например, образец A/Italy/49/2009(H1N1) был обнаружен в носу 26-летней женщины, вернувшейся из Италии в США. Вот первые 120 бит его генетического кода.

atgaaggcaa tactagtagt tctgctatat acatttgcaa ccgcaaatgc agacacatta

Сколько бит убьёт человека?
По приблизительным подсчётам, общий размер исходников H1N1 составляет 26 022 бит, а если исключить служебные стоп-сигналы (указывают на окончание каждой белковой последовательности), то исполняемый код состоит примерно из 25 054 бит. Это число является приблизительным ещё и потому, что в вирусе присутствует механизм генерации избыточного мусора для маскировки от антивирусов.

Итак, получается около 25 килобит или 3,2 килобайта. Таков объём кода для программы, имеющей ненулевые шансы убить человека. H1N1 написан гораздо эффективнее, чем компьютерный вирус MyDoom размером около 22 КБ.

Очень унизительно, что меня могут убить всего 3,2 КБ генетических данных. Впрочем, в 850 МБ человеческого генома по любому должны быть дыры для парочки эксплойтов.
Читать дальше →
]]> Wed, 02 Sep 2009 14:07:11 GMT alizar вирус гриппагрипп AH1N1мутациянуклеотидДНКРНКбиологическая угроза