Биотехнологии → Преступника вычислили по собачьему ДНК
В то время как попытки составить базу данных с образцами человеческих ДНК жёстко пресекаются правозащитниками, полиции приходится проявлять изобретательность. Недавний случай в Лондоне стал первым в истории криминалистики, когда вину убийцы доказали с помощью ДНК его собаки.
Членов бандитской группировки из Южного Лондона поймали после анализа пятнышка крови, которое оставил на месте преступления стаффордширский бультерьер. Он тоже участвовал в убийстве и случайно порезался во время нападения на жертву. Полиция смогла доказать, что владелец собаки тоже был на месте преступления.
Ещё более интересная история произошла пять лет назад в Германии. В лесу нашли труп женщины, закопанный под дубом. Вину мужа никак не удавалось доказать, пока в багажнике его машины не нашли кусочек дерева. Анализ показал, что это именно тот дуб, под которым нашли труп. У растений тоже есть ДНК.
via slashdot
Членов бандитской группировки из Южного Лондона поймали после анализа пятнышка крови, которое оставил на месте преступления стаффордширский бультерьер. Он тоже участвовал в убийстве и случайно порезался во время нападения на жертву. Полиция смогла доказать, что владелец собаки тоже был на месте преступления.
Ещё более интересная история произошла пять лет назад в Германии. В лесу нашли труп женщины, закопанный под дубом. Вину мужа никак не удавалось доказать, пока в багажнике его машины не нашли кусочек дерева. Анализ показал, что это именно тот дуб, под которым нашли труп. У растений тоже есть ДНК.
via slashdot
Научно-популярное → Генетический код 2.0
Открыт новый подход к использованию генетического материала, который позволит создавать белки со свойствами, невиданными в естественной среде. Открытие может когда-нибудь привести к созданию новой либо «улучшенной» формы жизни, которая вберет в себя эти новые материалы.
Во всех существующих формах жизни, четыре «буквы» генетического кода, называемые нуклеотидами, читаются триплетами, так что три нуклеотида кодируют аминокислоту.
Во всех существующих формах жизни, четыре «буквы» генетического кода, называемые нуклеотидами, читаются триплетами, так что три нуклеотида кодируют аминокислоту.
Лента новостей → Учёные расшифровали генетический код раковых клеток кожи и лёгких
Определив все гены рака, генетики надеются разработать новые лекарства, воздействующие на конкретные гены-мутанты.
В ДНК рака лёгких генетики насчитали 23 тысячи ошибок, в значительной степени спровоцированных воздействием табачного дыма.
Из этого учёные сделали вывод, что у среднего курильщика на каждые 15 выкуренных сигарет приходится по одному нарушению генетического кода.
В ДНК рака лёгких генетики насчитали 23 тысячи ошибок, в значительной степени спровоцированных воздействием табачного дыма.
Из этого учёные сделали вывод, что у среднего курильщика на каждые 15 выкуренных сигарет приходится по одному нарушению генетического кода.
Биотехнологии → О гриппе А (H1N1) с точки зрения программирования
Учёные уже полностью дизассемблировали H1N1 и занесли его в вирусную базу NCBI Influenza Virus Resource. Там всё задокументировано в подробностях. Например, образец A/Italy/49/2009(H1N1) был обнаружен в носу 26-летней женщины, вернувшейся из Италии в США. Вот первые 120 бит его генетического кода.atgaaggcaa tactagtagt tctgctatat acatttgcaa ccgcaaatgc agacacatta
Сколько бит убьёт человека?
По приблизительным подсчётам, общий размер исходников H1N1 составляет 26 022 бит, а если исключить служебные стоп-сигналы (указывают на окончание каждой белковой последовательности), то исполняемый код состоит примерно из 25 054 бит. Это число является приблизительным ещё и потому, что в вирусе присутствует механизм генерации избыточного мусора для маскировки от антивирусов.
Итак, получается около 25 килобит или 3,2 килобайта. Таков объём кода для программы, имеющей ненулевые шансы убить человека. H1N1 написан гораздо эффективнее, чем компьютерный вирус MyDoom размером около 22 КБ.
Очень унизительно, что меня могут убить всего 3,2 КБ генетических данных. Впрочем, в 850 МБ человеческого генома по любому должны быть дыры для парочки эксплойтов.
Железо → Транзистор из человеческих ДНК
Пару лет назад американский биолог Пол Ротмунд обнаружил, что молекулы ДНК обладают способностью к самосборке в различные правильные геометрические формы — треугольники, квадраты, звёздочки и т.д. (работа Ротмунда в PDF). Это действительно интересное открытие (оно вошло в список 12 самых важных научных открытий 2006 года) теоретически позволяет сделать из нашего ДНК нечто вроде конструктора «Лего».
Практическая реализация такой возможности не заставила себя долго ждать.
Практическая реализация такой возможности не заставила себя долго ждать.
Блог им. GrustniyKot → Yeah! Buy DNA Upgrade at 50% discount!
Размышления навеяны постом Стивен Хокинг призывает к апгрейду ДНК.
Заранее скажу, мне нравится сама идея апгрейда. Я хотел бы жить долго и счастливо, быть невероятно умным и сильным. И чтобы тоже самое было у моих родных, и у друзей, и у просто хороших людей. Я бы занимался открытиями, и заканчивал их сам даже спустя 100-200 лет. Я бы исследовал космос.
Но во первых любой человек — хороший до какого-то момента, особенно пока у него не появится преимущества над остальными. А во вторых, так просто не будет.
Если бы мы жили не в 2009 году, а в году в котором завтра открываются лаборатории по апгрейду ДНК — я не хотел бы там жить. Я не хотел бы наблюдать увядание расы.
Заранее скажу, мне нравится сама идея апгрейда. Я хотел бы жить долго и счастливо, быть невероятно умным и сильным. И чтобы тоже самое было у моих родных, и у друзей, и у просто хороших людей. Я бы занимался открытиями, и заканчивал их сам даже спустя 100-200 лет. Я бы исследовал космос.
Но во первых любой человек — хороший до какого-то момента, особенно пока у него не появится преимущества над остальными. А во вторых, так просто не будет.
Если бы мы жили не в 2009 году, а в году в котором завтра открываются лаборатории по апгрейду ДНК — я не хотел бы там жить. Я не хотел бы наблюдать увядание расы.
Будущее здесь → Стивен Хокинг призывает к апгрейду ДНК
Выделение хомо сапиенс в отдельный вид приматов потребовало несколько миллионов лет. За это время полезная часть ДНК изменилась на пару миллионов бит. Таким образом, скорость эволюции у людей можно примерно оценить как 1 бит в год. Так начинает свою лекцию “Жизнь во Вселенной” знаменитый Стивен Хокинг. Он говорит о появлении сверхчеловека, то есть новой расы людей, которая возникнет в результате резкого эволюционного скачка, когда люди начнут вносить исправления в собственную ДНК.
«Для сравнения, — продолжает профессор — сейчас каждый год публикуется 50 000 книг на английском языке, в сумме они содержат сотни миллиардов бит. Конечно, большая часть — бесполезный мусор, который невозможно использовать для жизни в какой бы то ни было форме. Однако, даже если так, всё равно скорость добавления полезной информации может быть в миллионы или миллиарды раз выше, чем сейчас в ДНК».
«Думаю, можно взглянуть на вещи шире и включить внешнюю [externally transmitted] информацию в эволюцию человеческой расы», — предлагает Стивен Хокинг.
На место отдельных участков ДНК можно интегрировать механико-электронные компоненты, которые постепенно могут полностью вытеснить ДНК из генома, также как ДНК вытеснила ранние формы жизни.
По мнению Хокинга, сначала следует устранить известные генетические дефекты, такие как фиброзно-кистозная дегенерация или мускульная дистрофия. За них отвечают единичные гены, которые довольно просто идентифицировать и исправить. Другие характеристики человека, такие как интеллект, будет непросто проапгрейдить, потому что за эти качества отвечают комплексы генов, и найти их будет сложнее, так же как определить связи между ними.
Однако, Стивен Хокинг уверен, что уже в течение ближайшего столетия люди найдут способы модифицировать интеллект и инстинкты, такие как агрессивность. Только так мы сможем избежать самоуничтожения и колонизировать другие планеты.
via The Daily Galaxy
Научно-популярное → Биология развития для гиков.
Сегодня я, как и обещал, начну цикл статей, посвященный биологии развития. Стиль изложения нарочито-технократический, так как именно информационные аналогии наиболее лучшим образом дают возможность понять, как устроена жизнь.
Биология развития – это такая наука, которая отвечает на вопрос, как именно, например, из клетки берется взрослый организм? В принципе регуляцию жизни одной единственной клетки можно рассматривать как базу биологии развития. С нее и начнем.
Биология развития – это такая наука, которая отвечает на вопрос, как именно, например, из клетки берется взрослый организм? В принципе регуляцию жизни одной единственной клетки можно рассматривать как базу биологии развития. С нее и начнем.
Биотехнологии → Генная инженерия от A до Z часть 3
Краткое содержание предыдущих серий:
Ученые открыли ген синего свечения. Мы прочитали об этом гене загорелись сделать светящуюся трансгенную елку. Нашли в специализированных ресурсах его название и последовательность, выбили командировку у шефа и скатались туда, где живет животное – бутявка, в которой содержится этот ген.
Путем различных ухищрений с применением специального оборудования мы получили чистые молекулы ДНК гена bl1.
К этим молекулам ДНК навесили служебные последовательности для работы внутри клетки, и создали трансгенные бактерии E.coli на их основе.
Ученые открыли ген синего свечения. Мы прочитали об этом гене загорелись сделать светящуюся трансгенную елку. Нашли в специализированных ресурсах его название и последовательность, выбили командировку у шефа и скатались туда, где живет животное – бутявка, в которой содержится этот ген.
Путем различных ухищрений с применением специального оборудования мы получили чистые молекулы ДНК гена bl1.
К этим молекулам ДНК навесили служебные последовательности для работы внутри клетки, и создали трансгенные бактерии E.coli на их основе.
Биотехнологии → Генная инженерия от A до Z часть 2
Итак, настало время продолжения статьи о том, как все же сделать светящуюся елку к следующему новому году с применением настоящей генной инженерии, а не той, о которой вы до этого могли прочитать в новостях :)
Краткое содержание предыдущей серии:
Ученые открыли ген синего свечения. Мы прочитали об этом гене и загорелись сделать светящуюся трансгенную елку. Нашли в специализированных ресурсах его название и последовательность, выбили командировку у шефа и скатались туда, где живет животное – бутявка, в которой содержится этот ген.
Путем различных ухищрений с применением специального оборудования мы получили чистые молекулы ДНК гена bl1, кодирующего белок синего свечения.
У нас есть ген. Чего же мы ждем, спросят читатели, давайте засунем этот ген в елку и она начнет светиться?
Не все так просто, и вот, почему.
Краткое содержание предыдущей серии:
Ученые открыли ген синего свечения. Мы прочитали об этом гене и загорелись сделать светящуюся трансгенную елку. Нашли в специализированных ресурсах его название и последовательность, выбили командировку у шефа и скатались туда, где живет животное – бутявка, в которой содержится этот ген.
Путем различных ухищрений с применением специального оборудования мы получили чистые молекулы ДНК гена bl1, кодирующего белок синего свечения.
У нас есть ген. Чего же мы ждем, спросят читатели, давайте засунем этот ген в елку и она начнет светиться?
Не все так просто, и вот, почему.