Открыт набор на курсы по биоинформатике в Санкт-Петербургском Академическом университете РАН на 2011/2012 год.

Курсы бесплатны и ориентированы на студентов средних и старших курсов информатических и математических специальностей, интересующихся биоинформатикой.

В ближайшие выходные, 12-13 июня, усилиями энтузиастов из Российского трансгуманистического движения в прямом эфире и на русском языке будет транслироваться проходящее в Гарвардском университете мероприятие под названием H+ Summit: Rise of the Citizen Scientist.

Думаю, на хабре уже не нужно напоминать, что такое трансгуманизм и H+; желающие могут ознакомиться с этим на сайте РТД. Перейдем сразу к делу. Тема нынешнего саммита — «Появление гражданина-ученого» — отражает явление, которое в общем-то исторически было присуще науке на ранних этапах ее становления в современной форме. Гражданином-ученым является любой человек, пользующийся научным методом для изучения самого себя или своей среды обитания с целью ответа на определенный вопрос или для удовлетворения любопытства. Такие личности, как Томас Джефферсон, Бенджамин Франклин, Эдвард Дженнер осуществляли свои открытия и изобретения, не будучи сотрудниками академий и университетов с дорогими лабораториями, а действуя непосредственно «в поле». Со временем наука заметно усложнилась, превратилась в огромный бюрократический институт и стала уделом профессионалов, в некотором смысле «отдалившись от народа». Заговорили даже о некоем «кризисе науки», о потере ею исходного предназначения. Но, как говорится, свято место пусто не бывает. Сегодня знамя гражданского научного поиска подхватывают энтузиасты, пользующиеся все дешевеющим компьютерным и биологическим оборудованием, изготовляющие нужные устройства самостоятельно и, что самое главное для этого ренессанса, обменивающиеся знаниями с помощью интернета и социальных сетей. Мы уже читали новости о «гаражных хакерах генома», о проектах типа OpenWetWare, BioBricks, о прогнозах Фримена Дайсона насчет «домашней биотехнологии» и т. д., а сегодня более 600 трансгуманистов — ученых, предпринимателей, писателей — собираются на саммите, чтобы обменяться идеями о дальнейшем развитии этого тренда и о перспективах, которые он открывает.

Какое отношение все это имеет к ИТ и к нам с вами? Самое прямое.

Я не специалист в биологии, и когда поднялась шумиха вокруг синтетической клетки Крейга Вентера, сразу не мог понять в чем соль. Давно уже известно, что геномо-инженеры кромсают бедные гены как хотят, и делают новые организмы с заранее заданными свойствами и т.д. Захотелось разобраться и понять, что же там действительно нового. Посмотрел, что об этом есть в сети. И вот, что на мой поверхностный взгляд, кажется, понял. Суть в том, что ранее всегда за исходный материал брались генный материал, синтезированный живыми клетками и над ними производились манипуляции. А теперь все манипуляции проводятся не с биологическим материалом в пробирке, а с записанным в компьютере и заранее расшифрованным, генетическим кодом. Таким образом главная задача состоит в том, чтобы сконструировать по заданной (и даже отредактированной по желанию программиста-биолога или даже программой) в компьютере последовательности ДНК реальную хромосому из отдельных нуклеиновых оснований (т.е. буквально из четырех банок с четырьмя исходными веществами) и активировать ее в клетке-реципиенте. Биологи, поправьте, если что не так.

Прошу простить за нереально огромный перерыв после первой части :(

Линк на первую часть (врожденный иммунитет)

Итак, нечто, проникшее в организм, было признано враждебным и уничтожено. Но каждый раз определять посторонние сущности по общим неспецифичным признакам — далеко не оптимальная концепция поведения, так как патогены могут выработать систему маскировки, которая предотвратит их обнаружение. Для того, чтобы обнаруживать этих микроорганизмов (а также увеличить эффективность реагирования по отношению ко всем остальным), возникла специфичная (она же приобретенная) иммунная система, которая включает в себя T-лимфоциты и B-лимфоциты, производящие антитела.

Многие годы ученые пытаются выявить зависимости между использование телефона и раком головного мозга. Недавно, эти исследования привели к необычным результатом. У мышей, с предрасположенностью к болезни Альцгеймера, облучение волнами, аналогичными волнам от телефона, привело к уменьшению вероятности развития этого заболевания. Так что, много говорить по мобильному телефону, может быть даже и полезно.

Про этом можно прочитать больше здесь (на английском языке).

По русски, можно прочитать здесь

Доброе время суток, уважаемое хабра-сообщество!

Это мой первый пост на Хабре, так что очень вас прошу, не судите слишком строго.

Я полагаю, все вы видели многочисленные рекламные ролики про уязвимый иммунитет, и все помнят школьные уроки, на которых рассказывалось про фагоцитов, пожирающих бактерий. Однако иммунная система организма — это сложнейший механизм, призванный оградить хозяина от любой опасности. А опасности могут быть очень разными. Я хотел бы попытаться рассказать о том, как иммунная система обнаруживает эти опасности, как она с ними борется, и как все это можно регулировать и использовать.

Нобелевская премия 2009 по химии

Исследования функций и структуры рибосом.

Венкатраман Рамакришнан (Venkatraman Ramakrishnan), США; Томас Стейц (Thomas Steitz), США; Ада Йонат (Ada Yonath), Израиль.

Как известно, структура любого организма запрограммирована изначально в генетическом коде и сохраняется в ДНК. По этой программе (после её копирования в РНК) происходит производство каждой молекулы нашего организма. Непосредственно компиляцией протеинов занимаются рибосомы — своеобразные роботизированные мини-фабрики, которые присутствуют в каждой клетке. До XXI века наука не знала подробностей этого процесса, но он стал гораздо понятнее благодаря работе, которую нынешние нобелевские лауреаты практически параллельно выполнили и опубликовали в 2000 году. Они в малейших деталях засняли рибосому с помощью крио-электронного микроскопа и составили функциональную 3D-карту этого органоида. За что и получили Нобелевскую премию по химии 2009 года.

Пару лет назад американский биолог Пол Ротмунд обнаружил, что молекулы ДНК обладают способностью к самосборке в различные правильные геометрические формы — треугольники, квадраты, звёздочки и т.д. (работа Ротмунда в PDF). Это действительно интересное открытие (оно вошло в список 12 самых важных научных открытий 2006 года) теоретически позволяет сделать из нашего ДНК нечто вроде конструктора «Лего».



Практическая реализация такой возможности не заставила себя долго ждать.

Сначала я хотел назвать этот топик «руководство по флирту», но потом подумал, что это бы было глупо и цинично по отношению к представительницам столь любимого нами прекрасного пола. В самом деле — разве есть для нас, мужчин, более нужные и приятные существа, чем девушки? И не надо кричать «компьютеры», против природы-то все равно не попрешь ;)