Проверьте, что вы переключились с «No highlighting» на Server или Client.

Они тянут именно OpenJDK, но не используют Swing (и AWT). Пользовательский интерфейс реализован на нативных компонентах через JNA что-ли. Не помню точно, не буду врать. Вообще, они open source, при желании можно посмотреть: trac.cyberduck.ch/

Нельзя рассчитывать на то, что dependency уже установлена или просить пользователя скачать (например, при первом запуске). А если включить в поставку — тогда все OK. И есть уже пионеры. Например, CyberDuck — ftp клиент.

Планируется. Но никаких конкретных сроков пока нет, так что скоро не будет.

1. Ваша правда. Мы используем command line утилиту xcodebuild (идет с Xcode-ом). Если у Вас там что-то, что нужно именно для сборки, имеет смысл сделать соответствущий Build Phase.
2. Это плохо, так не должно быть. Если этот pch открыть, там #import-ы красные? В любом случае было бы здорово видеть багрепорт здесь: youtrack.jetbrains.net/issues/OC, с деталями.
3. Как только такая возможность технически появится — подумаем. Но через наш сайт покупать тоже не сложно :)

Не совсем так. Если приложение будет тянуть Java с собой, то его можно распространять через AppStore. Но ту java-у, которая сейчас для Маков есть нельзя тянуть с собой по лицензионным соображениям, а OpenJDK еще пока не готов. Скажем, через годик, наверное, все будет хорошо.

Нет, и к сожалению не будет. Дело в том, что AppCode работает с Xcode-овским проектом, а Идея — с Идеевским. И их не скрестить никак.